Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Acss1Q99NB1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acss1Q99NB1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acss1Q99NB1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Acss1Q99NB1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acss1Q99NB1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acss1Q99NB1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acss1Q99NB1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acss1Q99NB1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Acss1Q99NB1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acss1Q99NB1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acss1Q99NB1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acss1Q99NB1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acss1Q99NB1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acss1Q99NB1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acss1Q99NB1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Acss1Q99NB1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Acss1Q99NB1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Acss1Q99NB1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Acss1Q99NB1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Acss1Q99NB1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Acss1Q99NB1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Acss1Q99NB1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Acss1Q99NB1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Acss1Q99NB1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Acss1Q99NB1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Acss1Q99NB1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Acss1Q99NB1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Acss1Q99NB1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Acss1Q99NB1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Acss1Q99NB1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Acss1Q99NB1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Acss1Q99NB1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Acss1Q99NB1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Acss1Q99NB1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Acss1Q99NB1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acss1Q99NB1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acss1Q99NB1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acss1Q99NB1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acss1Q99NB1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acss1Q99NB1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acss1Q99NB1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms