Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BrapQ99MP8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BrapQ99MP8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BrapQ99MP8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BrapQ99MP8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BrapQ99MP8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BrapQ99MP8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BrapQ99MP8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BrapQ99MP8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BrapQ99MP8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BrapQ99MP8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BrapQ99MP8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BrapQ99MP8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BrapQ99MP8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BrapQ99MP8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BrapQ99MP8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BrapQ99MP8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BrapQ99MP8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BrapQ99MP8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BrapQ99MP8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BrapQ99MP8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BrapQ99MP8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BrapQ99MP8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BrapQ99MP8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BrapQ99MP8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BrapQ99MP8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BrapQ99MP8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BrapQ99MP8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BrapQ99MP8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BrapQ99MP8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BrapQ99MP8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BrapQ99MP8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BrapQ99MP8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BrapQ99MP8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BrapQ99MP8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BrapQ99MP8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
BrapQ99MP8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BrapQ99MP8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BrapQ99MP8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BrapQ99MP8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BrapQ99MP8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BrapQ99MP8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BrapQ99MP8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BrapQ99MP8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BrapQ99MP8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BrapQ99MP8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BrapQ99MP8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BrapQ99MP8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BrapQ99MP8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BrapQ99MP8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BrapQ99MP8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BrapQ99MP8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BrapQ99MP8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
BrapQ99MP8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BrapQ99MP8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BrapQ99MP8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BrapQ99MP8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BrapQ99MP8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BrapQ99MP8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BrapQ99MP8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BrapQ99MP8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BrapQ99MP8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BrapQ99MP8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BrapQ99MP8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BrapQ99MP8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BrapQ99MP8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BrapQ99MP8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BrapQ99MP8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BrapQ99MP8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BrapQ99MP8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BrapQ99MP8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BrapQ99MP8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms