Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
Usp11Q99K46 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Usp11Q99K46 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Usp11Q99K46 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Usp11Q99K46 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Usp11Q99K46 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Usp11Q99K46 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Usp11Q99K46 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Usp11Q99K46 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Usp11Q99K46 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Usp11Q99K46 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Usp11Q99K46 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Usp11Q99K46 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Usp11Q99K46 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Usp11Q99K46 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
Usp11Q99K46 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Usp11Q99K46 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Usp11Q99K46 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Usp11Q99K46 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Usp11Q99K46 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Usp11Q99K46 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Usp11Q99K46 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Usp11Q99K46 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Usp11Q99K46 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Usp11Q99K46 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,68
Usp11Q99K46 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Usp11Q99K46 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Usp11Q99K46 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Usp11Q99K46 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Usp11Q99K46 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Usp11Q99K46 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Usp11Q99K46 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Usp11Q99K46 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Usp11Q99K46 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Usp11Q99K46 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Usp11Q99K46 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Usp11Q99K46 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Usp11Q99K46 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Usp11Q99K46 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Usp11Q99K46 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Usp11Q99K46 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Usp11Q99K46 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Usp11Q99K46 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Usp11Q99K46 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Usp11Q99K46 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Usp11Q99K46 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Usp11Q99K46 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Usp11Q99K46 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Usp11Q99K46 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Usp11Q99K46 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Usp11Q99K46 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms