Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ufsp2Q99K23 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ufsp2Q99K23 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ufsp2Q99K23 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ufsp2Q99K23 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ufsp2Q99K23 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ufsp2Q99K23 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ufsp2Q99K23 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ufsp2Q99K23 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ufsp2Q99K23 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ufsp2Q99K23 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ufsp2Q99K23 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ufsp2Q99K23 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ufsp2Q99K23 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ufsp2Q99K23 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ufsp2Q99K23 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ufsp2Q99K23 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ufsp2Q99K23 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms