Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf144aQ925F3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf144aQ925F3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf144aQ925F3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf144aQ925F3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf144aQ925F3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf144aQ925F3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf144aQ925F3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf144aQ925F3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf144aQ925F3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf144aQ925F3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf144aQ925F3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf144aQ925F3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf144aQ925F3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf144aQ925F3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf144aQ925F3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf144aQ925F3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf144aQ925F3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf144aQ925F3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf144aQ925F3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf144aQ925F3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf144aQ925F3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf144aQ925F3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf144aQ925F3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf144aQ925F3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf144aQ925F3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms