Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmo1Q924W9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmo1Q924W9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmo1Q924W9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmo1Q924W9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmo1Q924W9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmo1Q924W9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmo1Q924W9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmo1Q924W9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmo1Q924W9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmo1Q924W9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmo1Q924W9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmo1Q924W9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmo1Q924W9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms