Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc9Q8VC31 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc9Q8VC31 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc9Q8VC31 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc9Q8VC31 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc9Q8VC31 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc9Q8VC31 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc9Q8VC31 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc9Q8VC31 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc9Q8VC31 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc9Q8VC31 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc9Q8VC31 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc9Q8VC31 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc9Q8VC31 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc9Q8VC31 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc9Q8VC31 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc9Q8VC31 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc9Q8VC31 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc9Q8VC31 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc9Q8VC31 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc9Q8VC31 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc9Q8VC31 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc9Q8VC31 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc9Q8VC31 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc9Q8VC31 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc9Q8VC31 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc9Q8VC31 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc9Q8VC31 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc9Q8VC31 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc9Q8VC31 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc9Q8VC31 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc9Q8VC31 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc9Q8VC31 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc9Q8VC31 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc9Q8VC31 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc9Q8VC31 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc9Q8VC31 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc9Q8VC31 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc9Q8VC31 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc9Q8VC31 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc9Q8VC31 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc9Q8VC31 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc9Q8VC31 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc9Q8VC31 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc9Q8VC31 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc9Q8VC31 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc9Q8VC31 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc9Q8VC31 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc9Q8VC31 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc9Q8VC31 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc9Q8VC31 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc9Q8VC31 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc9Q8VC31 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc9Q8VC31 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc9Q8VC31 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc9Q8VC31 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc9Q8VC31 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc9Q8VC31 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms