Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim29Q8R2Q0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim29Q8R2Q0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim29Q8R2Q0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim29Q8R2Q0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim29Q8R2Q0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim29Q8R2Q0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim29Q8R2Q0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim29Q8R2Q0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim29Q8R2Q0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim29Q8R2Q0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trim29Q8R2Q0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim29Q8R2Q0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim29Q8R2Q0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim29Q8R2Q0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim29Q8R2Q0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim29Q8R2Q0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim29Q8R2Q0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim29Q8R2Q0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim29Q8R2Q0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim29Q8R2Q0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim29Q8R2Q0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim29Q8R2Q0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim29Q8R2Q0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim29Q8R2Q0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim29Q8R2Q0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim29Q8R2Q0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim29Q8R2Q0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim29Q8R2Q0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim29Q8R2Q0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim29Q8R2Q0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim29Q8R2Q0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim29Q8R2Q0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim29Q8R2Q0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim29Q8R2Q0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim29Q8R2Q0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim29Q8R2Q0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim29Q8R2Q0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim29Q8R2Q0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim29Q8R2Q0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim29Q8R2Q0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim29Q8R2Q0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trim29Q8R2Q0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trim29Q8R2Q0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim29Q8R2Q0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim29Q8R2Q0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim29Q8R2Q0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim29Q8R2Q0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim29Q8R2Q0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim29Q8R2Q0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim29Q8R2Q0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim29Q8R2Q0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms