Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N0

Ccdc59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc59Q8R2N0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc59Q8R2N0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc59Q8R2N0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc59Q8R2N0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc59Q8R2N0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc59Q8R2N0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc59Q8R2N0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc59Q8R2N0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc59Q8R2N0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc59Q8R2N0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc59Q8R2N0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc59Q8R2N0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc59Q8R2N0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc59Q8R2N0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc59Q8R2N0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc59Q8R2N0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc59Q8R2N0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc59Q8R2N0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc59Q8R2N0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc59Q8R2N0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc59Q8R2N0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc59Q8R2N0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc59Q8R2N0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc59Q8R2N0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc59Q8R2N0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc59Q8R2N0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc59Q8R2N0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc59Q8R2N0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc59Q8R2N0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc59Q8R2N0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc59Q8R2N0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc59Q8R2N0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc59Q8R2N0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms