Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1L4

Kdelr3, ER lumen protein-retaining receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr3Q8R1L4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdelr3Q8R1L4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdelr3Q8R1L4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdelr3Q8R1L4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdelr3Q8R1L4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdelr3Q8R1L4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdelr3Q8R1L4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdelr3Q8R1L4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdelr3Q8R1L4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdelr3Q8R1L4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdelr3Q8R1L4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdelr3Q8R1L4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdelr3Q8R1L4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdelr3Q8R1L4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdelr3Q8R1L4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdelr3Q8R1L4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdelr3Q8R1L4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdelr3Q8R1L4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdelr3Q8R1L4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdelr3Q8R1L4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdelr3Q8R1L4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdelr3Q8R1L4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdelr3Q8R1L4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdelr3Q8R1L4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdelr3Q8R1L4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdelr3Q8R1L4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdelr3Q8R1L4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdelr3Q8R1L4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdelr3Q8R1L4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdelr3Q8R1L4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdelr3Q8R1L4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdelr3Q8R1L4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdelr3Q8R1L4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdelr3Q8R1L4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdelr3Q8R1L4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdelr3Q8R1L4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdelr3Q8R1L4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdelr3Q8R1L4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdelr3Q8R1L4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdelr3Q8R1L4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms