Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps37bQ8R0J7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps37bQ8R0J7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps37bQ8R0J7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vps37bQ8R0J7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps37bQ8R0J7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps37bQ8R0J7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps37bQ8R0J7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps37bQ8R0J7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps37bQ8R0J7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps37bQ8R0J7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps37bQ8R0J7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps37bQ8R0J7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps37bQ8R0J7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps37bQ8R0J7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps37bQ8R0J7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps37bQ8R0J7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps37bQ8R0J7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps37bQ8R0J7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps37bQ8R0J7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps37bQ8R0J7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps37bQ8R0J7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps37bQ8R0J7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps37bQ8R0J7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps37bQ8R0J7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps37bQ8R0J7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps37bQ8R0J7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps37bQ8R0J7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps37bQ8R0J7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps37bQ8R0J7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps37bQ8R0J7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps37bQ8R0J7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps37bQ8R0J7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps37bQ8R0J7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps37bQ8R0J7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps37bQ8R0J7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps37bQ8R0J7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps37bQ8R0J7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps37bQ8R0J7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps37bQ8R0J7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps37bQ8R0J7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps37bQ8R0J7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps37bQ8R0J7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps37bQ8R0J7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps37bQ8R0J7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps37bQ8R0J7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps37bQ8R0J7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps37bQ8R0J7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps37bQ8R0J7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms