Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc5Q8K4Z2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc5Q8K4Z2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc5Q8K4Z2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc5Q8K4Z2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc5Q8K4Z2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc5Q8K4Z2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc5Q8K4Z2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc5Q8K4Z2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc5Q8K4Z2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc5Q8K4Z2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc5Q8K4Z2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc5Q8K4Z2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc5Q8K4Z2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc5Q8K4Z2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc5Q8K4Z2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc5Q8K4Z2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc5Q8K4Z2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc5Q8K4Z2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc5Q8K4Z2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc5Q8K4Z2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc5Q8K4Z2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc5Q8K4Z2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc5Q8K4Z2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc5Q8K4Z2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc5Q8K4Z2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc5Q8K4Z2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc5Q8K4Z2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc5Q8K4Z2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc5Q8K4Z2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc5Q8K4Z2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc5Q8K4Z2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc5Q8K4Z2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms