Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z0

Lgi2, Leucine-rich repeat LGI family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi2Q8K4Z0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lgi2Q8K4Z0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lgi2Q8K4Z0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lgi2Q8K4Z0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lgi2Q8K4Z0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lgi2Q8K4Z0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lgi2Q8K4Z0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lgi2Q8K4Z0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lgi2Q8K4Z0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lgi2Q8K4Z0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lgi2Q8K4Z0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lgi2Q8K4Z0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lgi2Q8K4Z0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lgi2Q8K4Z0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lgi2Q8K4Z0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lgi2Q8K4Z0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lgi2Q8K4Z0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lgi2Q8K4Z0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Lgi2Q8K4Z0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lgi2Q8K4Z0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lgi2Q8K4Z0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lgi2Q8K4Z0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lgi2Q8K4Z0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lgi2Q8K4Z0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lgi2Q8K4Z0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lgi2Q8K4Z0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lgi2Q8K4Z0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lgi2Q8K4Z0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lgi2Q8K4Z0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lgi2Q8K4Z0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lgi2Q8K4Z0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Lgi2Q8K4Z0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lgi2Q8K4Z0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lgi2Q8K4Z0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lgi2Q8K4Z0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lgi2Q8K4Z0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lgi2Q8K4Z0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lgi2Q8K4Z0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lgi2Q8K4Z0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lgi2Q8K4Z0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lgi2Q8K4Z0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lgi2Q8K4Z0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lgi2Q8K4Z0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lgi2Q8K4Z0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lgi2Q8K4Z0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lgi2Q8K4Z0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lgi2Q8K4Z0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lgi2Q8K4Z0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lgi2Q8K4Z0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lgi2Q8K4Z0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lgi2Q8K4Z0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lgi2Q8K4Z0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lgi2Q8K4Z0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lgi2Q8K4Z0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lgi2Q8K4Z0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lgi2Q8K4Z0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lgi2Q8K4Z0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lgi2Q8K4Z0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lgi2Q8K4Z0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lgi2Q8K4Z0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lgi2Q8K4Z0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lgi2Q8K4Z0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgi2Q8K4Z0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgi2Q8K4Z0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgi2Q8K4Z0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lgi2Q8K4Z0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lgi2Q8K4Z0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgi2Q8K4Z0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgi2Q8K4Z0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgi2Q8K4Z0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgi2Q8K4Z0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lgi2Q8K4Z0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lgi2Q8K4Z0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms