Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms