Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ltbp4Q8K4G1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ltbp4Q8K4G1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ltbp4Q8K4G1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ltbp4Q8K4G1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ltbp4Q8K4G1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ltbp4Q8K4G1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ltbp4Q8K4G1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ltbp4Q8K4G1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ltbp4Q8K4G1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ltbp4Q8K4G1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ltbp4Q8K4G1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ltbp4Q8K4G1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ltbp4Q8K4G1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ltbp4Q8K4G1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ltbp4Q8K4G1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ltbp4Q8K4G1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ltbp4Q8K4G1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ltbp4Q8K4G1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ltbp4Q8K4G1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ltbp4Q8K4G1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ltbp4Q8K4G1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ltbp4Q8K4G1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ltbp4Q8K4G1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ltbp4Q8K4G1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ltbp4Q8K4G1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ltbp4Q8K4G1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ltbp4Q8K4G1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ltbp4Q8K4G1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ltbp4Q8K4G1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ltbp4Q8K4G1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.3
Ltbp4Q8K4G1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ltbp4Q8K4G1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ltbp4Q8K4G1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ltbp4Q8K4G1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ltbp4Q8K4G1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ltbp4Q8K4G1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ltbp4Q8K4G1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ltbp4Q8K4G1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ltbp4Q8K4G1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ltbp4Q8K4G1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ltbp4Q8K4G1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ltbp4Q8K4G1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ltbp4Q8K4G1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ltbp4Q8K4G1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ltbp4Q8K4G1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ltbp4Q8K4G1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ltbp4Q8K4G1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ltbp4Q8K4G1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ltbp4Q8K4G1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ltbp4Q8K4G1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ltbp4Q8K4G1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ltbp4Q8K4G1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ltbp4Q8K4G1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ltbp4Q8K4G1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ltbp4Q8K4G1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ltbp4Q8K4G1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ltbp4Q8K4G1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ltbp4Q8K4G1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ltbp4Q8K4G1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ltbp4Q8K4G1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Ltbp4Q8K4G1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ltbp4Q8K4G1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ltbp4Q8K4G1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ltbp4Q8K4G1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ltbp4Q8K4G1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ltbp4Q8K4G1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ltbp4Q8K4G1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ltbp4Q8K4G1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ltbp4Q8K4G1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ltbp4Q8K4G1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ltbp4Q8K4G1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ltbp4Q8K4G1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ltbp4Q8K4G1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ltbp4Q8K4G1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ltbp4Q8K4G1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ltbp4Q8K4G1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ltbp4Q8K4G1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ltbp4Q8K4G1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ltbp4Q8K4G1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ltbp4Q8K4G1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ltbp4Q8K4G1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ltbp4Q8K4G1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ltbp4Q8K4G1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms