Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv3Q8K424 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv3Q8K424 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv3Q8K424 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv3Q8K424 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv3Q8K424 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv3Q8K424 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv3Q8K424 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv3Q8K424 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpv3Q8K424 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpv3Q8K424 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpv3Q8K424 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv3Q8K424 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpv3Q8K424 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpv3Q8K424 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpv3Q8K424 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpv3Q8K424 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpv3Q8K424 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv3Q8K424 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv3Q8K424 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv3Q8K424 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv3Q8K424 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv3Q8K424 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv3Q8K424 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv3Q8K424 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv3Q8K424 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv3Q8K424 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpv3Q8K424 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpv3Q8K424 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv3Q8K424 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv3Q8K424 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms