Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Otud6bQ8K2H2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Otud6bQ8K2H2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Otud6bQ8K2H2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Otud6bQ8K2H2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Otud6bQ8K2H2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Otud6bQ8K2H2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Otud6bQ8K2H2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Otud6bQ8K2H2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Otud6bQ8K2H2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Otud6bQ8K2H2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Otud6bQ8K2H2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Otud6bQ8K2H2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Otud6bQ8K2H2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Otud6bQ8K2H2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Otud6bQ8K2H2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Otud6bQ8K2H2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Otud6bQ8K2H2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Otud6bQ8K2H2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Otud6bQ8K2H2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Otud6bQ8K2H2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Otud6bQ8K2H2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Otud6bQ8K2H2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Otud6bQ8K2H2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Otud6bQ8K2H2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Otud6bQ8K2H2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Otud6bQ8K2H2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Otud6bQ8K2H2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Otud6bQ8K2H2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Otud6bQ8K2H2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Otud6bQ8K2H2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Otud6bQ8K2H2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Otud6bQ8K2H2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Otud6bQ8K2H2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Otud6bQ8K2H2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Otud6bQ8K2H2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Otud6bQ8K2H2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Otud6bQ8K2H2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Otud6bQ8K2H2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Otud6bQ8K2H2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Otud6bQ8K2H2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Otud6bQ8K2H2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Otud6bQ8K2H2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Otud6bQ8K2H2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Otud6bQ8K2H2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Otud6bQ8K2H2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Otud6bQ8K2H2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Otud6bQ8K2H2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Otud6bQ8K2H2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Otud6bQ8K2H2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Otud6bQ8K2H2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms