Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hacd3Q8K2C9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hacd3Q8K2C9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hacd3Q8K2C9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hacd3Q8K2C9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hacd3Q8K2C9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hacd3Q8K2C9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hacd3Q8K2C9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hacd3Q8K2C9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hacd3Q8K2C9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hacd3Q8K2C9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hacd3Q8K2C9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hacd3Q8K2C9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hacd3Q8K2C9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hacd3Q8K2C9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hacd3Q8K2C9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hacd3Q8K2C9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hacd3Q8K2C9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hacd3Q8K2C9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hacd3Q8K2C9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hacd3Q8K2C9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hacd3Q8K2C9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hacd3Q8K2C9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hacd3Q8K2C9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hacd3Q8K2C9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hacd3Q8K2C9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hacd3Q8K2C9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hacd3Q8K2C9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hacd3Q8K2C9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hacd3Q8K2C9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hacd3Q8K2C9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hacd3Q8K2C9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hacd3Q8K2C9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hacd3Q8K2C9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hacd3Q8K2C9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hacd3Q8K2C9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hacd3Q8K2C9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hacd3Q8K2C9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hacd3Q8K2C9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hacd3Q8K2C9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hacd3Q8K2C9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hacd3Q8K2C9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hacd3Q8K2C9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hacd3Q8K2C9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hacd3Q8K2C9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hacd3Q8K2C9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hacd3Q8K2C9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hacd3Q8K2C9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hacd3Q8K2C9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hacd3Q8K2C9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hacd3Q8K2C9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hacd3Q8K2C9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hacd3Q8K2C9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms