Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gin1Q8K259 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gin1Q8K259 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gin1Q8K259 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gin1Q8K259 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gin1Q8K259 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gin1Q8K259 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gin1Q8K259 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gin1Q8K259 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gin1Q8K259 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gin1Q8K259 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gin1Q8K259 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gin1Q8K259 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gin1Q8K259 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gin1Q8K259 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gin1Q8K259 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gin1Q8K259 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gin1Q8K259 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gin1Q8K259 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gin1Q8K259 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gin1Q8K259 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gin1Q8K259 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gin1Q8K259 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gin1Q8K259 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gin1Q8K259 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gin1Q8K259 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gin1Q8K259 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gin1Q8K259 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gin1Q8K259 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gin1Q8K259 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gin1Q8K259 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gin1Q8K259 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gin1Q8K259 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gin1Q8K259 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gin1Q8K259 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gin1Q8K259 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gin1Q8K259 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gin1Q8K259 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gin1Q8K259 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gin1Q8K259 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gin1Q8K259 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gin1Q8K259 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gin1Q8K259 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gin1Q8K259 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gin1Q8K259 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gin1Q8K259 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gin1Q8K259 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gin1Q8K259 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gin1Q8K259 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gin1Q8K259 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gin1Q8K259 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gin1Q8K259 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gin1Q8K259 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gin1Q8K259 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gin1Q8K259 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gin1Q8K259 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gin1Q8K259 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gin1Q8K259 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gin1Q8K259 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gin1Q8K259 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gin1Q8K259 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms