Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H7

Slc45a3, Solute carrier family 45 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a3Q8K0H7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc45a3Q8K0H7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc45a3Q8K0H7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc45a3Q8K0H7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc45a3Q8K0H7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc45a3Q8K0H7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc45a3Q8K0H7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc45a3Q8K0H7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc45a3Q8K0H7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc45a3Q8K0H7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc45a3Q8K0H7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc45a3Q8K0H7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc45a3Q8K0H7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc45a3Q8K0H7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc45a3Q8K0H7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc45a3Q8K0H7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc45a3Q8K0H7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc45a3Q8K0H7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc45a3Q8K0H7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc45a3Q8K0H7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc45a3Q8K0H7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc45a3Q8K0H7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc45a3Q8K0H7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc45a3Q8K0H7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc45a3Q8K0H7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc45a3Q8K0H7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc45a3Q8K0H7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc45a3Q8K0H7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc45a3Q8K0H7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc45a3Q8K0H7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc45a3Q8K0H7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc45a3Q8K0H7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc45a3Q8K0H7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc45a3Q8K0H7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc45a3Q8K0H7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc45a3Q8K0H7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc45a3Q8K0H7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc45a3Q8K0H7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc45a3Q8K0H7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms