Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ27

Aspm, Abnormal spindle-like microcephaly-associated protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AspmQ8CJ27 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
AspmQ8CJ27 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
AspmQ8CJ27 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
AspmQ8CJ27 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
AspmQ8CJ27 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
AspmQ8CJ27 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
AspmQ8CJ27 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
AspmQ8CJ27 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
AspmQ8CJ27 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
AspmQ8CJ27 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
AspmQ8CJ27 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
AspmQ8CJ27 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,66■■□□□ 1,7
AspmQ8CJ27 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25,64■■□□□ 1,7
AspmQ8CJ27 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
AspmQ8CJ27 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
AspmQ8CJ27 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
AspmQ8CJ27 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25,61■■□□□ 1,69
AspmQ8CJ27 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25,6■■□□□ 1,69
AspmQ8CJ27 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
AspmQ8CJ27 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,59■■□□□ 1,69
AspmQ8CJ27 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
AspmQ8CJ27 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
AspmQ8CJ27 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
AspmQ8CJ27 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
AspmQ8CJ27 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
AspmQ8CJ27 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,53■■□□□ 1,68
AspmQ8CJ27 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
AspmQ8CJ27 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
AspmQ8CJ27 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
AspmQ8CJ27 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
AspmQ8CJ27 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
AspmQ8CJ27 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25,49■■□□□ 1,67
AspmQ8CJ27 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
AspmQ8CJ27 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
AspmQ8CJ27 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
AspmQ8CJ27 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25,47■■□□□ 1,67
AspmQ8CJ27 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
AspmQ8CJ27 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25,46■■□□□ 1,67
AspmQ8CJ27 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
AspmQ8CJ27 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
AspmQ8CJ27 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
AspmQ8CJ27 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
AspmQ8CJ27 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
AspmQ8CJ27 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
AspmQ8CJ27 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
AspmQ8CJ27 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
AspmQ8CJ27 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25,4■■□□□ 1,66
AspmQ8CJ27 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
AspmQ8CJ27 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,39■■□□□ 1,66
AspmQ8CJ27 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25,39■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25,36■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25,33■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
AspmQ8CJ27 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25,32■■□□□ 1,64
AspmQ8CJ27 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
AspmQ8CJ27 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
AspmQ8CJ27 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,31■■□□□ 1,64
AspmQ8CJ27 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
AspmQ8CJ27 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25,3■■□□□ 1,64
AspmQ8CJ27 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
AspmQ8CJ27 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
AspmQ8CJ27 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
AspmQ8CJ27 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,27■■□□□ 1,64
AspmQ8CJ27 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
AspmQ8CJ27 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25,27■■□□□ 1,64
AspmQ8CJ27 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,24■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,23■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,22■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,2■■□□□ 1,63
AspmQ8CJ27 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
AspmQ8CJ27 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,19■■□□□ 1,62
AspmQ8CJ27 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
AspmQ8CJ27 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,8 ms