Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIB5

Fermt2, Fermitin family homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt2Q8CIB5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Fermt2Q8CIB5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fermt2Q8CIB5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fermt2Q8CIB5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fermt2Q8CIB5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fermt2Q8CIB5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fermt2Q8CIB5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fermt2Q8CIB5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fermt2Q8CIB5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fermt2Q8CIB5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fermt2Q8CIB5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fermt2Q8CIB5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fermt2Q8CIB5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fermt2Q8CIB5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fermt2Q8CIB5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Fermt2Q8CIB5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fermt2Q8CIB5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fermt2Q8CIB5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fermt2Q8CIB5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fermt2Q8CIB5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fermt2Q8CIB5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fermt2Q8CIB5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fermt2Q8CIB5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Fermt2Q8CIB5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fermt2Q8CIB5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fermt2Q8CIB5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fermt2Q8CIB5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fermt2Q8CIB5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fermt2Q8CIB5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fermt2Q8CIB5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fermt2Q8CIB5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fermt2Q8CIB5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fermt2Q8CIB5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fermt2Q8CIB5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fermt2Q8CIB5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fermt2Q8CIB5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Fermt2Q8CIB5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fermt2Q8CIB5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Fermt2Q8CIB5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fermt2Q8CIB5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fermt2Q8CIB5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fermt2Q8CIB5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fermt2Q8CIB5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fermt2Q8CIB5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fermt2Q8CIB5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28■■■□□ 2.07
Fermt2Q8CIB5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Fermt2Q8CIB5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fermt2Q8CIB5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fermt2Q8CIB5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fermt2Q8CIB5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fermt2Q8CIB5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fermt2Q8CIB5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fermt2Q8CIB5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fermt2Q8CIB5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fermt2Q8CIB5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fermt2Q8CIB5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fermt2Q8CIB5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Fermt2Q8CIB5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms