Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csnka2ipQ8CH19 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csnka2ipQ8CH19 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csnka2ipQ8CH19 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csnka2ipQ8CH19 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csnka2ipQ8CH19 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csnka2ipQ8CH19 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csnka2ipQ8CH19 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csnka2ipQ8CH19 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csnka2ipQ8CH19 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Csnka2ipQ8CH19 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Csnka2ipQ8CH19 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csnka2ipQ8CH19 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csnka2ipQ8CH19 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csnka2ipQ8CH19 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csnka2ipQ8CH19 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csnka2ipQ8CH19 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csnka2ipQ8CH19 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csnka2ipQ8CH19 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csnka2ipQ8CH19 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csnka2ipQ8CH19 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csnka2ipQ8CH19 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csnka2ipQ8CH19 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csnka2ipQ8CH19 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csnka2ipQ8CH19 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csnka2ipQ8CH19 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csnka2ipQ8CH19 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Csnka2ipQ8CH19 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csnka2ipQ8CH19 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csnka2ipQ8CH19 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Csnka2ipQ8CH19 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Csnka2ipQ8CH19 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csnka2ipQ8CH19 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csnka2ipQ8CH19 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csnka2ipQ8CH19 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csnka2ipQ8CH19 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csnka2ipQ8CH19 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csnka2ipQ8CH19 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csnka2ipQ8CH19 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csnka2ipQ8CH19 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Csnka2ipQ8CH19 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csnka2ipQ8CH19 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csnka2ipQ8CH19 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csnka2ipQ8CH19 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csnka2ipQ8CH19 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csnka2ipQ8CH19 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csnka2ipQ8CH19 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csnka2ipQ8CH19 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms