Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2Q8CDM1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2Q8CDM1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atad2Q8CDM1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atad2Q8CDM1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atad2Q8CDM1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atad2Q8CDM1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atad2Q8CDM1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Atad2Q8CDM1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2Q8CDM1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2Q8CDM1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2Q8CDM1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2Q8CDM1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2Q8CDM1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad2Q8CDM1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad2Q8CDM1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Atad2Q8CDM1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atad2Q8CDM1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atad2Q8CDM1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atad2Q8CDM1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atad2Q8CDM1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atad2Q8CDM1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atad2Q8CDM1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atad2Q8CDM1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atad2Q8CDM1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atad2Q8CDM1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atad2Q8CDM1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atad2Q8CDM1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atad2Q8CDM1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atad2Q8CDM1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atad2Q8CDM1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atad2Q8CDM1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Atad2Q8CDM1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atad2Q8CDM1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atad2Q8CDM1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atad2Q8CDM1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atad2Q8CDM1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Atad2Q8CDM1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atad2Q8CDM1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Atad2Q8CDM1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atad2Q8CDM1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atad2Q8CDM1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atad2Q8CDM1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atad2Q8CDM1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atad2Q8CDM1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atad2Q8CDM1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atad2Q8CDM1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atad2Q8CDM1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atad2Q8CDM1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atad2Q8CDM1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atad2Q8CDM1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atad2Q8CDM1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atad2Q8CDM1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atad2Q8CDM1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atad2Q8CDM1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Atad2Q8CDM1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Atad2Q8CDM1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atad2Q8CDM1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atad2Q8CDM1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atad2Q8CDM1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atad2Q8CDM1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms