Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI6

Ccdc158, Coiled-coil domain-containing protein 158, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc158Q8CDI6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ccdc158Q8CDI6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Ccdc158Q8CDI6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ccdc158Q8CDI6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ccdc158Q8CDI6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ccdc158Q8CDI6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ccdc158Q8CDI6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ccdc158Q8CDI6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ccdc158Q8CDI6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ccdc158Q8CDI6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Ccdc158Q8CDI6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ccdc158Q8CDI6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29,26■■■□□ 2,28
Ccdc158Q8CDI6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ccdc158Q8CDI6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ccdc158Q8CDI6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ccdc158Q8CDI6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ccdc158Q8CDI6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ccdc158Q8CDI6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ccdc158Q8CDI6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ccdc158Q8CDI6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ccdc158Q8CDI6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ccdc158Q8CDI6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Ccdc158Q8CDI6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Ccdc158Q8CDI6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Ccdc158Q8CDI6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Ccdc158Q8CDI6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Ccdc158Q8CDI6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Ccdc158Q8CDI6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Ccdc158Q8CDI6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ccdc158Q8CDI6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ccdc158Q8CDI6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ccdc158Q8CDI6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ccdc158Q8CDI6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Ccdc158Q8CDI6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Ccdc158Q8CDI6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Ccdc158Q8CDI6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ccdc158Q8CDI6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ccdc158Q8CDI6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ccdc158Q8CDI6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ccdc158Q8CDI6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ccdc158Q8CDI6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ccdc158Q8CDI6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ccdc158Q8CDI6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Ccdc158Q8CDI6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Ccdc158Q8CDI6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Ccdc158Q8CDI6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Ccdc158Q8CDI6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Ccdc158Q8CDI6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Ccdc158Q8CDI6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Ccdc158Q8CDI6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Ccdc158Q8CDI6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Ccdc158Q8CDI6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Ccdc158Q8CDI6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Ccdc158Q8CDI6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Ccdc158Q8CDI6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ccdc158Q8CDI6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ccdc158Q8CDI6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,9 ms