Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sfrp1Q8C4U3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sfrp1Q8C4U3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sfrp1Q8C4U3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sfrp1Q8C4U3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sfrp1Q8C4U3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sfrp1Q8C4U3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sfrp1Q8C4U3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sfrp1Q8C4U3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sfrp1Q8C4U3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sfrp1Q8C4U3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sfrp1Q8C4U3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sfrp1Q8C4U3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sfrp1Q8C4U3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sfrp1Q8C4U3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sfrp1Q8C4U3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sfrp1Q8C4U3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sfrp1Q8C4U3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sfrp1Q8C4U3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sfrp1Q8C4U3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfrp1Q8C4U3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sfrp1Q8C4U3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sfrp1Q8C4U3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sfrp1Q8C4U3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sfrp1Q8C4U3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sfrp1Q8C4U3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sfrp1Q8C4U3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sfrp1Q8C4U3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sfrp1Q8C4U3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sfrp1Q8C4U3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sfrp1Q8C4U3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sfrp1Q8C4U3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sfrp1Q8C4U3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sfrp1Q8C4U3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sfrp1Q8C4U3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sfrp1Q8C4U3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sfrp1Q8C4U3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sfrp1Q8C4U3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sfrp1Q8C4U3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sfrp1Q8C4U3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfrp1Q8C4U3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfrp1Q8C4U3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sfrp1Q8C4U3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sfrp1Q8C4U3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sfrp1Q8C4U3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sfrp1Q8C4U3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sfrp1Q8C4U3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sfrp1Q8C4U3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sfrp1Q8C4U3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sfrp1Q8C4U3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sfrp1Q8C4U3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sfrp1Q8C4U3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sfrp1Q8C4U3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sfrp1Q8C4U3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sfrp1Q8C4U3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfrp1Q8C4U3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfrp1Q8C4U3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfrp1Q8C4U3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfrp1Q8C4U3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms