Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA0

Lrfn5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn5Q8BXA0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrfn5Q8BXA0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrfn5Q8BXA0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrfn5Q8BXA0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrfn5Q8BXA0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrfn5Q8BXA0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrfn5Q8BXA0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrfn5Q8BXA0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrfn5Q8BXA0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrfn5Q8BXA0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrfn5Q8BXA0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrfn5Q8BXA0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrfn5Q8BXA0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrfn5Q8BXA0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrfn5Q8BXA0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrfn5Q8BXA0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrfn5Q8BXA0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrfn5Q8BXA0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrfn5Q8BXA0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrfn5Q8BXA0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrfn5Q8BXA0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrfn5Q8BXA0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrfn5Q8BXA0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrfn5Q8BXA0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrfn5Q8BXA0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrfn5Q8BXA0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrfn5Q8BXA0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrfn5Q8BXA0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms