Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLE7

Slc17a6, Vesicular glutamate transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a6Q8BLE7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc17a6Q8BLE7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc17a6Q8BLE7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc17a6Q8BLE7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc17a6Q8BLE7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a6Q8BLE7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc17a6Q8BLE7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc17a6Q8BLE7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc17a6Q8BLE7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc17a6Q8BLE7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc17a6Q8BLE7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc17a6Q8BLE7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc17a6Q8BLE7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc17a6Q8BLE7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc17a6Q8BLE7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc17a6Q8BLE7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc17a6Q8BLE7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc17a6Q8BLE7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc17a6Q8BLE7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc17a6Q8BLE7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc17a6Q8BLE7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc17a6Q8BLE7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc17a6Q8BLE7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc17a6Q8BLE7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc17a6Q8BLE7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc17a6Q8BLE7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc17a6Q8BLE7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc17a6Q8BLE7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc17a6Q8BLE7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc17a6Q8BLE7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc17a6Q8BLE7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc17a6Q8BLE7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc17a6Q8BLE7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc17a6Q8BLE7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc17a6Q8BLE7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc17a6Q8BLE7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc17a6Q8BLE7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc17a6Q8BLE7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc17a6Q8BLE7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc17a6Q8BLE7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc17a6Q8BLE7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms