Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc9Q8BJN4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc9Q8BJN4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc9Q8BJN4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc9Q8BJN4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fndc9Q8BJN4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc9Q8BJN4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc9Q8BJN4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc9Q8BJN4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc9Q8BJN4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms