Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmd4aQ8BIE6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmd4aQ8BIE6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmd4aQ8BIE6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmd4aQ8BIE6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmd4aQ8BIE6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmd4aQ8BIE6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmd4aQ8BIE6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmd4aQ8BIE6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmd4aQ8BIE6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Frmd4aQ8BIE6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmd4aQ8BIE6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Frmd4aQ8BIE6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmd4aQ8BIE6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmd4aQ8BIE6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmd4aQ8BIE6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmd4aQ8BIE6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmd4aQ8BIE6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmd4aQ8BIE6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmd4aQ8BIE6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmd4aQ8BIE6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmd4aQ8BIE6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmd4aQ8BIE6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmd4aQ8BIE6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmd4aQ8BIE6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmd4aQ8BIE6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmd4aQ8BIE6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmd4aQ8BIE6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmd4aQ8BIE6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmd4aQ8BIE6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmd4aQ8BIE6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmd4aQ8BIE6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmd4aQ8BIE6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmd4aQ8BIE6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmd4aQ8BIE6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmd4aQ8BIE6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmd4aQ8BIE6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmd4aQ8BIE6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmd4aQ8BIE6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmd4aQ8BIE6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmd4aQ8BIE6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmd4aQ8BIE6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmd4aQ8BIE6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmd4aQ8BIE6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmd4aQ8BIE6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmd4aQ8BIE6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmd4aQ8BIE6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmd4aQ8BIE6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmd4aQ8BIE6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmd4aQ8BIE6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms