Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms