Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmco3Q8BH01 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmco3Q8BH01 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmco3Q8BH01 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmco3Q8BH01 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmco3Q8BH01 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmco3Q8BH01 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms