Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrtm2Q8BGA3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrtm2Q8BGA3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrtm2Q8BGA3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrtm2Q8BGA3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrtm2Q8BGA3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrtm2Q8BGA3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrtm2Q8BGA3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrtm2Q8BGA3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrtm2Q8BGA3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrtm2Q8BGA3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrtm2Q8BGA3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrtm2Q8BGA3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrtm2Q8BGA3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrtm2Q8BGA3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrtm2Q8BGA3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrtm2Q8BGA3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrtm2Q8BGA3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrtm2Q8BGA3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms