Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmtc4Q8BG19 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmtc4Q8BG19 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmtc4Q8BG19 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmtc4Q8BG19 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmtc4Q8BG19 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmtc4Q8BG19 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmtc4Q8BG19 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmtc4Q8BG19 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmtc4Q8BG19 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmtc4Q8BG19 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmtc4Q8BG19 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmtc4Q8BG19 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmtc4Q8BG19 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmtc4Q8BG19 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmtc4Q8BG19 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmtc4Q8BG19 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmtc4Q8BG19 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmtc4Q8BG19 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmtc4Q8BG19 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmtc4Q8BG19 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmtc4Q8BG19 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmtc4Q8BG19 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmtc4Q8BG19 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmtc4Q8BG19 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmtc4Q8BG19 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmtc4Q8BG19 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmtc4Q8BG19 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmtc4Q8BG19 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmtc4Q8BG19 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmtc4Q8BG19 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmtc4Q8BG19 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmtc4Q8BG19 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmtc4Q8BG19 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmtc4Q8BG19 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmtc4Q8BG19 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmtc4Q8BG19 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmtc4Q8BG19 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmtc4Q8BG19 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmtc4Q8BG19 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmtc4Q8BG19 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmtc4Q8BG19 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmtc4Q8BG19 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmtc4Q8BG19 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc4Q8BG19 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmtc4Q8BG19 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmtc4Q8BG19 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmtc4Q8BG19 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmtc4Q8BG19 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc4Q8BG19 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmtc4Q8BG19 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmtc4Q8BG19 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmtc4Q8BG19 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmtc4Q8BG19 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc4Q8BG19 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc4Q8BG19 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc4Q8BG19 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc4Q8BG19 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmtc4Q8BG19 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmtc4Q8BG19 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmtc4Q8BG19 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmtc4Q8BG19 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmtc4Q8BG19 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmtc4Q8BG19 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmtc4Q8BG19 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc4Q8BG19 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc4Q8BG19 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc4Q8BG19 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc4Q8BG19 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc4Q8BG19 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc4Q8BG19 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms