Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Srgap3Q812A2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Srgap3Q812A2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Srgap3Q812A2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Srgap3Q812A2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Srgap3Q812A2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30,88■■■□□ 2,53
Srgap3Q812A2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Srgap3Q812A2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Srgap3Q812A2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Srgap3Q812A2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Srgap3Q812A2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Srgap3Q812A2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Srgap3Q812A2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Srgap3Q812A2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Srgap3Q812A2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Srgap3Q812A2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30,73■■■□□ 2,51
Srgap3Q812A2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30,73■■■□□ 2,51
Srgap3Q812A2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Srgap3Q812A2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Srgap3Q812A2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Srgap3Q812A2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Srgap3Q812A2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30,67■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Srgap3Q812A2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30,58■■■□□ 2,49
Srgap3Q812A2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Srgap3Q812A2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30,56■■■□□ 2,48
Srgap3Q812A2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Srgap3Q812A2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Srgap3Q812A2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Srgap3Q812A2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Srgap3Q812A2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Srgap3Q812A2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Srgap3Q812A2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30,45■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Srgap3Q812A2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30,44■■■□□ 2,46
Srgap3Q812A2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Srgap3Q812A2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Srgap3Q812A2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Srgap3Q812A2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Srgap3Q812A2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Srgap3Q812A2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Srgap3Q812A2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Srgap3Q812A2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Srgap3Q812A2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Srgap3Q812A2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Srgap3Q812A2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,45
Srgap3Q812A2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms