Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prima1Q810F0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prima1Q810F0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prima1Q810F0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prima1Q810F0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prima1Q810F0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prima1Q810F0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prima1Q810F0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prima1Q810F0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prima1Q810F0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prima1Q810F0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prima1Q810F0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prima1Q810F0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prima1Q810F0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prima1Q810F0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prima1Q810F0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prima1Q810F0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prima1Q810F0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prima1Q810F0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prima1Q810F0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prima1Q810F0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prima1Q810F0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prima1Q810F0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prima1Q810F0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prima1Q810F0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prima1Q810F0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prima1Q810F0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prima1Q810F0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prima1Q810F0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prima1Q810F0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prima1Q810F0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prima1Q810F0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prima1Q810F0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prima1Q810F0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prima1Q810F0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prima1Q810F0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms