Protein–RNA interactions for Protein: Q80TS7

Ddn, Dendrin, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DdnQ80TS7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DdnQ80TS7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DdnQ80TS7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DdnQ80TS7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DdnQ80TS7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DdnQ80TS7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DdnQ80TS7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DdnQ80TS7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DdnQ80TS7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DdnQ80TS7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DdnQ80TS7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DdnQ80TS7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DdnQ80TS7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DdnQ80TS7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DdnQ80TS7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DdnQ80TS7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DdnQ80TS7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DdnQ80TS7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DdnQ80TS7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DdnQ80TS7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DdnQ80TS7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DdnQ80TS7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DdnQ80TS7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DdnQ80TS7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DdnQ80TS7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DdnQ80TS7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DdnQ80TS7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DdnQ80TS7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DdnQ80TS7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DdnQ80TS7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DdnQ80TS7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DdnQ80TS7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DdnQ80TS7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DdnQ80TS7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DdnQ80TS7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DdnQ80TS7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DdnQ80TS7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms