Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ62

Podn, Podocan, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PodnQ7TQ62 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
PodnQ7TQ62 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
PodnQ7TQ62 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
PodnQ7TQ62 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
PodnQ7TQ62 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
PodnQ7TQ62 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
PodnQ7TQ62 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
PodnQ7TQ62 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
PodnQ7TQ62 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
PodnQ7TQ62 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
PodnQ7TQ62 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
PodnQ7TQ62 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2
PodnQ7TQ62 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
PodnQ7TQ62 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27,56■■■□□ 2
PodnQ7TQ62 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
PodnQ7TQ62 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
PodnQ7TQ62 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
PodnQ7TQ62 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
PodnQ7TQ62 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
PodnQ7TQ62 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,52■■■□□ 2
PodnQ7TQ62 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,51■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27,48■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,46■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
PodnQ7TQ62 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
PodnQ7TQ62 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
PodnQ7TQ62 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
PodnQ7TQ62 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27,43■■□□□ 1,98
PodnQ7TQ62 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
PodnQ7TQ62 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27,42■■□□□ 1,98
PodnQ7TQ62 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
PodnQ7TQ62 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
PodnQ7TQ62 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
PodnQ7TQ62 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
PodnQ7TQ62 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27,39■■□□□ 1,98
PodnQ7TQ62 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
PodnQ7TQ62 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
PodnQ7TQ62 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
PodnQ7TQ62 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
PodnQ7TQ62 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
PodnQ7TQ62 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
PodnQ7TQ62 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
PodnQ7TQ62 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
PodnQ7TQ62 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
PodnQ7TQ62 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,3■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
PodnQ7TQ62 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
PodnQ7TQ62 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
PodnQ7TQ62 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
PodnQ7TQ62 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
PodnQ7TQ62 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,25■■□□□ 1,95
PodnQ7TQ62 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
PodnQ7TQ62 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
PodnQ7TQ62 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
PodnQ7TQ62 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
PodnQ7TQ62 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
PodnQ7TQ62 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
PodnQ7TQ62 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
PodnQ7TQ62 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27,2■■□□□ 1,94
PodnQ7TQ62 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
PodnQ7TQ62 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,1 ms