Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf250Q7TNU6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Znf250Q7TNU6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf250Q7TNU6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf250Q7TNU6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf250Q7TNU6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf250Q7TNU6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf250Q7TNU6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf250Q7TNU6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf250Q7TNU6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf250Q7TNU6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf250Q7TNU6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf250Q7TNU6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf250Q7TNU6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf250Q7TNU6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf250Q7TNU6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf250Q7TNU6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf250Q7TNU6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf250Q7TNU6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf250Q7TNU6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf250Q7TNU6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf250Q7TNU6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf250Q7TNU6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf250Q7TNU6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf250Q7TNU6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf250Q7TNU6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf250Q7TNU6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms