Protein–RNA interactions for Protein: Q78PG9

Ccdc25, Coiled-coil domain-containing protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc25Q78PG9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc25Q78PG9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc25Q78PG9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc25Q78PG9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc25Q78PG9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc25Q78PG9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc25Q78PG9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc25Q78PG9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc25Q78PG9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc25Q78PG9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc25Q78PG9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc25Q78PG9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc25Q78PG9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc25Q78PG9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc25Q78PG9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc25Q78PG9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc25Q78PG9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc25Q78PG9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc25Q78PG9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc25Q78PG9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc25Q78PG9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc25Q78PG9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc25Q78PG9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc25Q78PG9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc25Q78PG9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc25Q78PG9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc25Q78PG9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc25Q78PG9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc25Q78PG9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc25Q78PG9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc25Q78PG9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc25Q78PG9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc25Q78PG9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc25Q78PG9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc25Q78PG9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc25Q78PG9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc25Q78PG9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc25Q78PG9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc25Q78PG9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc25Q78PG9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc25Q78PG9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc25Q78PG9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc25Q78PG9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc25Q78PG9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc25Q78PG9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc25Q78PG9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc25Q78PG9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc25Q78PG9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc25Q78PG9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc25Q78PG9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc25Q78PG9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc25Q78PG9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc25Q78PG9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc25Q78PG9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc25Q78PG9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc25Q78PG9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc25Q78PG9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc25Q78PG9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc25Q78PG9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc25Q78PG9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc25Q78PG9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc25Q78PG9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc25Q78PG9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc25Q78PG9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc25Q78PG9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc25Q78PG9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc25Q78PG9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms