Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GypcQ78HU7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GypcQ78HU7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GypcQ78HU7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GypcQ78HU7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GypcQ78HU7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GypcQ78HU7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GypcQ78HU7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GypcQ78HU7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GypcQ78HU7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GypcQ78HU7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GypcQ78HU7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GypcQ78HU7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GypcQ78HU7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GypcQ78HU7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GypcQ78HU7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GypcQ78HU7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GypcQ78HU7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GypcQ78HU7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GypcQ78HU7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GypcQ78HU7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GypcQ78HU7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GypcQ78HU7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GypcQ78HU7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GypcQ78HU7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GypcQ78HU7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GypcQ78HU7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GypcQ78HU7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GypcQ78HU7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GypcQ78HU7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GypcQ78HU7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GypcQ78HU7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GypcQ78HU7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GypcQ78HU7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GypcQ78HU7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GypcQ78HU7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GypcQ78HU7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GypcQ78HU7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GypcQ78HU7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GypcQ78HU7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GypcQ78HU7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GypcQ78HU7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GypcQ78HU7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GypcQ78HU7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GypcQ78HU7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GypcQ78HU7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GypcQ78HU7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GypcQ78HU7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GypcQ78HU7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GypcQ78HU7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GypcQ78HU7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GypcQ78HU7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GypcQ78HU7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GypcQ78HU7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GypcQ78HU7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GypcQ78HU7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GypcQ78HU7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GypcQ78HU7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GypcQ78HU7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GypcQ78HU7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GypcQ78HU7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GypcQ78HU7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GypcQ78HU7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GypcQ78HU7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GypcQ78HU7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GypcQ78HU7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GypcQ78HU7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GypcQ78HU7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GypcQ78HU7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GypcQ78HU7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GypcQ78HU7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GypcQ78HU7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GypcQ78HU7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms