Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Efr3bQ6ZQ18 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Efr3bQ6ZQ18 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Efr3bQ6ZQ18 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Efr3bQ6ZQ18 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Efr3bQ6ZQ18 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Efr3bQ6ZQ18 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Efr3bQ6ZQ18 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Efr3bQ6ZQ18 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Efr3bQ6ZQ18 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Efr3bQ6ZQ18 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Efr3bQ6ZQ18 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Efr3bQ6ZQ18 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Efr3bQ6ZQ18 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Efr3bQ6ZQ18 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Efr3bQ6ZQ18 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Efr3bQ6ZQ18 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Efr3bQ6ZQ18 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Efr3bQ6ZQ18 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Efr3bQ6ZQ18 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Efr3bQ6ZQ18 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Efr3bQ6ZQ18 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Efr3bQ6ZQ18 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efr3bQ6ZQ18 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Efr3bQ6ZQ18 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Efr3bQ6ZQ18 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Efr3bQ6ZQ18 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Efr3bQ6ZQ18 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Efr3bQ6ZQ18 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efr3bQ6ZQ18 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efr3bQ6ZQ18 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efr3bQ6ZQ18 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efr3bQ6ZQ18 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efr3bQ6ZQ18 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efr3bQ6ZQ18 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efr3bQ6ZQ18 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Efr3bQ6ZQ18 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Efr3bQ6ZQ18 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efr3bQ6ZQ18 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efr3bQ6ZQ18 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efr3bQ6ZQ18 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efr3bQ6ZQ18 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efr3bQ6ZQ18 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efr3bQ6ZQ18 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efr3bQ6ZQ18 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Efr3bQ6ZQ18 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Efr3bQ6ZQ18 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efr3bQ6ZQ18 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Efr3bQ6ZQ18 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efr3bQ6ZQ18 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efr3bQ6ZQ18 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efr3bQ6ZQ18 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efr3bQ6ZQ18 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efr3bQ6ZQ18 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efr3bQ6ZQ18 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efr3bQ6ZQ18 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Efr3bQ6ZQ18 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efr3bQ6ZQ18 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efr3bQ6ZQ18 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efr3bQ6ZQ18 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efr3bQ6ZQ18 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efr3bQ6ZQ18 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efr3bQ6ZQ18 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms