Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shc4Q6S5L9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shc4Q6S5L9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shc4Q6S5L9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shc4Q6S5L9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shc4Q6S5L9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shc4Q6S5L9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shc4Q6S5L9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shc4Q6S5L9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shc4Q6S5L9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shc4Q6S5L9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shc4Q6S5L9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shc4Q6S5L9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shc4Q6S5L9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shc4Q6S5L9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shc4Q6S5L9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shc4Q6S5L9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shc4Q6S5L9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Shc4Q6S5L9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shc4Q6S5L9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Shc4Q6S5L9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shc4Q6S5L9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shc4Q6S5L9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Shc4Q6S5L9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shc4Q6S5L9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shc4Q6S5L9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shc4Q6S5L9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shc4Q6S5L9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shc4Q6S5L9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shc4Q6S5L9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shc4Q6S5L9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shc4Q6S5L9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shc4Q6S5L9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shc4Q6S5L9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shc4Q6S5L9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shc4Q6S5L9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shc4Q6S5L9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shc4Q6S5L9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms