Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sarm1Q6PDS3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sarm1Q6PDS3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sarm1Q6PDS3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sarm1Q6PDS3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sarm1Q6PDS3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sarm1Q6PDS3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sarm1Q6PDS3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sarm1Q6PDS3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sarm1Q6PDS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sarm1Q6PDS3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sarm1Q6PDS3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sarm1Q6PDS3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sarm1Q6PDS3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sarm1Q6PDS3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sarm1Q6PDS3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sarm1Q6PDS3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sarm1Q6PDS3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sarm1Q6PDS3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sarm1Q6PDS3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sarm1Q6PDS3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sarm1Q6PDS3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sarm1Q6PDS3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sarm1Q6PDS3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sarm1Q6PDS3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sarm1Q6PDS3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sarm1Q6PDS3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sarm1Q6PDS3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sarm1Q6PDS3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sarm1Q6PDS3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sarm1Q6PDS3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sarm1Q6PDS3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sarm1Q6PDS3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sarm1Q6PDS3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sarm1Q6PDS3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sarm1Q6PDS3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sarm1Q6PDS3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sarm1Q6PDS3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sarm1Q6PDS3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sarm1Q6PDS3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sarm1Q6PDS3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sarm1Q6PDS3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sarm1Q6PDS3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms