Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB90

Pcdhb14, Protocadherin beta-14, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb14Q6PB90 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Pcdhb14Q6PB90 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Pcdhb14Q6PB90 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Pcdhb14Q6PB90 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Pcdhb14Q6PB90 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Pcdhb14Q6PB90 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Pcdhb14Q6PB90 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Pcdhb14Q6PB90 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Pcdhb14Q6PB90 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Pcdhb14Q6PB90 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Pcdhb14Q6PB90 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Pcdhb14Q6PB90 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Pcdhb14Q6PB90 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Pcdhb14Q6PB90 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Pcdhb14Q6PB90 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Pcdhb14Q6PB90 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Pcdhb14Q6PB90 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Pcdhb14Q6PB90 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Pcdhb14Q6PB90 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Pcdhb14Q6PB90 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Pcdhb14Q6PB90 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,08
Pcdhb14Q6PB90 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Pcdhb14Q6PB90 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Pcdhb14Q6PB90 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Pcdhb14Q6PB90 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Pcdhb14Q6PB90 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Pcdhb14Q6PB90 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Pcdhb14Q6PB90 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Pcdhb14Q6PB90 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Pcdhb14Q6PB90 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Pcdhb14Q6PB90 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Pcdhb14Q6PB90 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Pcdhb14Q6PB90 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Pcdhb14Q6PB90 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Pcdhb14Q6PB90 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Pcdhb14Q6PB90 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Pcdhb14Q6PB90 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Pcdhb14Q6PB90 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Pcdhb14Q6PB90 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Pcdhb14Q6PB90 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Pcdhb14Q6PB90 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Pcdhb14Q6PB90 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Pcdhb14Q6PB90 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Pcdhb14Q6PB90 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Pcdhb14Q6PB90 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Pcdhb14Q6PB90 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Pcdhb14Q6PB90 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Pcdhb14Q6PB90 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Pcdhb14Q6PB90 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Pcdhb14Q6PB90 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Pcdhb14Q6PB90 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Pcdhb14Q6PB90 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Pcdhb14Q6PB90 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Pcdhb14Q6PB90 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Pcdhb14Q6PB90 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Pcdhb14Q6PB90 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Pcdhb14Q6PB90 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Pcdhb14Q6PB90 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Pcdhb14Q6PB90 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pcdhb14Q6PB90 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pcdhb14Q6PB90 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pcdhb14Q6PB90 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pcdhb14Q6PB90 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pcdhb14Q6PB90 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Pcdhb14Q6PB90 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Pcdhb14Q6PB90 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Pcdhb14Q6PB90 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Pcdhb14Q6PB90 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Pcdhb14Q6PB90 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Pcdhb14Q6PB90 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Pcdhb14Q6PB90 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Pcdhb14Q6PB90 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Pcdhb14Q6PB90 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Pcdhb14Q6PB90 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Pcdhb14Q6PB90 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Pcdhb14Q6PB90 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Pcdhb14Q6PB90 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Pcdhb14Q6PB90 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Pcdhb14Q6PB90 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Pcdhb14Q6PB90 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Pcdhb14Q6PB90 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,01
Pcdhb14Q6PB90 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Pcdhb14Q6PB90 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Pcdhb14Q6PB90 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Pcdhb14Q6PB90 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,6 ms