Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh2Q6P6J4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Alkbh2Q6P6J4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Alkbh2Q6P6J4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Alkbh2Q6P6J4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Alkbh2Q6P6J4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms