Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrig3Q6P1C6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrig3Q6P1C6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrig3Q6P1C6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrig3Q6P1C6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrig3Q6P1C6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrig3Q6P1C6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrig3Q6P1C6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrig3Q6P1C6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrig3Q6P1C6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrig3Q6P1C6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrig3Q6P1C6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrig3Q6P1C6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrig3Q6P1C6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrig3Q6P1C6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrig3Q6P1C6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrig3Q6P1C6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrig3Q6P1C6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrig3Q6P1C6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrig3Q6P1C6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrig3Q6P1C6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrig3Q6P1C6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrig3Q6P1C6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrig3Q6P1C6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrig3Q6P1C6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrig3Q6P1C6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrig3Q6P1C6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrig3Q6P1C6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrig3Q6P1C6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrig3Q6P1C6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrig3Q6P1C6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrig3Q6P1C6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrig3Q6P1C6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrig3Q6P1C6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrig3Q6P1C6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrig3Q6P1C6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrig3Q6P1C6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrig3Q6P1C6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrig3Q6P1C6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrig3Q6P1C6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrig3Q6P1C6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrig3Q6P1C6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrig3Q6P1C6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrig3Q6P1C6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrig3Q6P1C6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrig3Q6P1C6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrig3Q6P1C6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrig3Q6P1C6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrig3Q6P1C6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrig3Q6P1C6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrig3Q6P1C6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrig3Q6P1C6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrig3Q6P1C6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrig3Q6P1C6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrig3Q6P1C6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrig3Q6P1C6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrig3Q6P1C6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrig3Q6P1C6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrig3Q6P1C6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrig3Q6P1C6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrig3Q6P1C6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrig3Q6P1C6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrig3Q6P1C6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrig3Q6P1C6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrig3Q6P1C6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrig3Q6P1C6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrig3Q6P1C6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrig3Q6P1C6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrig3Q6P1C6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrig3Q6P1C6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrig3Q6P1C6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrig3Q6P1C6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrig3Q6P1C6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrig3Q6P1C6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrig3Q6P1C6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrig3Q6P1C6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrig3Q6P1C6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrig3Q6P1C6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrig3Q6P1C6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrig3Q6P1C6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrig3Q6P1C6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrig3Q6P1C6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrig3Q6P1C6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrig3Q6P1C6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms