Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Paxip1Q6NZQ4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Paxip1Q6NZQ4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Paxip1Q6NZQ4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Paxip1Q6NZQ4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Paxip1Q6NZQ4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Paxip1Q6NZQ4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Paxip1Q6NZQ4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Paxip1Q6NZQ4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Paxip1Q6NZQ4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Paxip1Q6NZQ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Paxip1Q6NZQ4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Paxip1Q6NZQ4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Paxip1Q6NZQ4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Paxip1Q6NZQ4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Paxip1Q6NZQ4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Paxip1Q6NZQ4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Paxip1Q6NZQ4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Paxip1Q6NZQ4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Paxip1Q6NZQ4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Paxip1Q6NZQ4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Paxip1Q6NZQ4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Paxip1Q6NZQ4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Paxip1Q6NZQ4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Paxip1Q6NZQ4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Paxip1Q6NZQ4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Paxip1Q6NZQ4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Paxip1Q6NZQ4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Paxip1Q6NZQ4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Paxip1Q6NZQ4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Paxip1Q6NZQ4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Paxip1Q6NZQ4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Paxip1Q6NZQ4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Paxip1Q6NZQ4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Paxip1Q6NZQ4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms