Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retreg2Q6NS82 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retreg2Q6NS82 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retreg2Q6NS82 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retreg2Q6NS82 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retreg2Q6NS82 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retreg2Q6NS82 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retreg2Q6NS82 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retreg2Q6NS82 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retreg2Q6NS82 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retreg2Q6NS82 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retreg2Q6NS82 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retreg2Q6NS82 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retreg2Q6NS82 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retreg2Q6NS82 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retreg2Q6NS82 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retreg2Q6NS82 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retreg2Q6NS82 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retreg2Q6NS82 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retreg2Q6NS82 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retreg2Q6NS82 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retreg2Q6NS82 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retreg2Q6NS82 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retreg2Q6NS82 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retreg2Q6NS82 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retreg2Q6NS82 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retreg2Q6NS82 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retreg2Q6NS82 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retreg2Q6NS82 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Retreg2Q6NS82 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retreg2Q6NS82 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retreg2Q6NS82 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retreg2Q6NS82 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retreg2Q6NS82 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retreg2Q6NS82 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retreg2Q6NS82 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retreg2Q6NS82 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retreg2Q6NS82 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retreg2Q6NS82 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retreg2Q6NS82 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retreg2Q6NS82 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retreg2Q6NS82 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retreg2Q6NS82 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retreg2Q6NS82 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retreg2Q6NS82 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retreg2Q6NS82 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retreg2Q6NS82 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retreg2Q6NS82 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retreg2Q6NS82 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retreg2Q6NS82 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retreg2Q6NS82 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retreg2Q6NS82 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retreg2Q6NS82 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retreg2Q6NS82 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms