Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt72Q6IME9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt72Q6IME9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt72Q6IME9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt72Q6IME9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt72Q6IME9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt72Q6IME9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt72Q6IME9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt72Q6IME9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt72Q6IME9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt72Q6IME9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt72Q6IME9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt72Q6IME9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt72Q6IME9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt72Q6IME9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt72Q6IME9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt72Q6IME9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt72Q6IME9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt72Q6IME9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt72Q6IME9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt72Q6IME9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt72Q6IME9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt72Q6IME9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt72Q6IME9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms