Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spock1Q62288 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spock1Q62288 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spock1Q62288 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spock1Q62288 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spock1Q62288 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spock1Q62288 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spock1Q62288 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spock1Q62288 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spock1Q62288 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spock1Q62288 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spock1Q62288 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spock1Q62288 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spock1Q62288 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spock1Q62288 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spock1Q62288 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spock1Q62288 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spock1Q62288 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spock1Q62288 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spock1Q62288 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spock1Q62288 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spock1Q62288 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spock1Q62288 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spock1Q62288 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spock1Q62288 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spock1Q62288 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spock1Q62288 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spock1Q62288 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spock1Q62288 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spock1Q62288 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spock1Q62288 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spock1Q62288 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Spock1Q62288 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Spock1Q62288 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Spock1Q62288 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spock1Q62288 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Spock1Q62288 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Spock1Q62288 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spock1Q62288 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spock1Q62288 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spock1Q62288 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spock1Q62288 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Spock1Q62288 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Spock1Q62288 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spock1Q62288 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spock1Q62288 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spock1Q62288 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spock1Q62288 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spock1Q62288 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spock1Q62288 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spock1Q62288 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spock1Q62288 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spock1Q62288 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spock1Q62288 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spock1Q62288 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Spock1Q62288 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spock1Q62288 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms